是武警总医院的“龙头”学科，技术力量雄厚，专业特色突出，形成了由移植外科、移植内科、移植ICU组成的优势学科联合体。"肝脏移植的临床研究及应用"获国家科技进步二等奖。

武警总医院整合神经创伤外科、神经肿瘤外科、神经血管外科、神经内科、神经干细胞移植科、脊髓空洞症科等七个科室组成的又一优势学科，汇聚了国内多位神经科学领域知名专家，标志着武警总医院又一个大型学科联合体初步形成。

拥有国内最先进的全套前庭功能检查及诊断治疗系统，并享有自主知识产权，是目前国际上最新的良性阵发性位置性眩晕诊断复位设备，能为眩晕患者提供比较系统、明确的诊断，实现了良性阵发性位置性眩晕诊治的新突破。

武警部队纳米医学研究所于2003年7月18日在武警总医院正式成立，为国内首家纳米医学研究所，掌握着目前纳米医学领域的最前沿技术。

武警部队优生优育中心在治疗上充分体现了个性化、人性化原则，全面开展整体化治疗及责任制护理措施，深受患者欢迎。该中心由儿科和妇产科共同组成。

是一所集临床、教学和科研于一身的研究机构，承担着全国、全军疑难眼眶病的诊治任务，有最先进的影像学研究室、莱卡病理设备及图像处理系，是我国成立最早的眼眶病研究所之一。

心血管内科介入治疗中心在冠心病、先天性心脏病等领域处于国内领先水平，经挠动脉介入治疗已形成特色，达国际先进水平。
心血管外科在先天性心脏病、后天性瓣膜病、冠状动脉硬化性心脏病等外科手术治疗达国内领先水平。

由临床经验丰富的资深医师组成，开展了多项国际国内领先的脊柱外科高难度手术，对脊柱退行性病变的诊治具有专业特色，在治疗严重脊柱侧凸和后凸畸形，颈腰椎疾患的微创手术方面取得了突破性效果，总有效率达到98%以上。

武警总医院肿瘤中心分为肿瘤一科、肿瘤二科和放疗部。目前已形成了以肿瘤综合治疗为特色的医学专科中心。

口腔医学中心是武警部队的医学专科中心，在颌面整形、颌面创伤和口腔修复外科以及心血管病拔牙等领域达到军内领先水平。