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肝移植研究所
  成立于2001年底,由国内著名肝移植专家沈中阳教授担任中心主任和研究所所长,并配有一支较强的专家队伍。
 
眼眶研究所
  2002年5月18日武警部队眼眶病研究所正式成立。主要以诊治眼眶肿瘤闻名国内,专业技术力量雄厚,诊治眼眶病的水平代表了国内最高水平,国外先进水平。
 
心脏病研究所
 

武警总医院心血管病介入治疗中心综合实力达到军内先进水平。

武警总医院心血管外科具有突出的技术特色,居国内领先水平。

 
纳米医学研究所
  武警部队纳米医学研究所于2003年7月18日在武警总医院正式成立,为国内首家纳米医学研究所,纪小龙教授任所长。
 
肛肠病研究所
  武警总医院肛肠病研究所是重点学科,技术力量雄厚,在肛肠疾病的手术治疗领域居军内外领先水平。该研究所配有国内一流的纤维结肠镜、微波手术治疗仪,电子手术治疗仪、冷光源乙状结肠镜、高科技电切治疗仪,全自动中药坐浴器等
 
肿瘤放疗中心
  武警总医院肿瘤中心是集医疗、科研、教学为一体的现代化高科技、高标准、高起点的大型肿瘤诊治研究中心,该中心设备齐全、治疗技术先进,是灵顿国际癌症研究合作中心之一,同时被批准为国家药品监督管理局国家药品临床研究基地
 
心内介入中心
  本中心系武警部队及武警总医院的重点学科,是国内开展介入治疗较早单位,经桡动脉介入治疗,已达国内先进水平。
 
口腔中心
  口腔科是武警部队的医学专科中心,在颌面整形、颌面创伤和口腔修复外科以及心血管病拔牙等领域达到军内领先水平
 
骨科中心
  骨科为武警部队医学专科中心,下设四肢骨科和脊柱外科两个专业和一个生物力学研究室。广泛开展了各种难度较大的手术,部分项目达到国内较先进水平。
 
优生优育中心
 

妇产科为我院重点特色学科,2003年被国家人口委员会和计划生育委员会评为“计划生育科技工作先进集体”,2004年被全国妇联授予“全国三八红旗先进集体”。

儿科为综合儿科,1997年被评为首批“爰婴医院”,2000年又通过了北京市“爱婴医院”复核评审,2001年及2003年分别被评为医院基层建设先进单位

 
 
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